58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  59.87 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  62.95 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  57.98 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  56.48 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  57.24 
 
 		 406 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  56.23 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  53.9 
 
 		 430 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  51.79 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  55.96 
 
 		 313 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  55.96 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  48.2 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  44.18 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  46.98 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  50.66 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  47.49 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  47.49 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  46.46 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  47.49 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  44.82 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  46.15 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  46.8 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  46.58 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  48.14 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  44.04 
 
 		 571 aa  228  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  45.27 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  43.2 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  46.49 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  45.61 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  44.93 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  44.03 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  40.34 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  42.05 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  40.27 
 
 		 337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  39.53 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  38.49 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  38.02 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.02 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.74 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  27.19 
 
 		 456 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  23.71 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.93 
 
 		 428 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  24.88 
 
 		 458 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  25.52 
 
 		 445 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  22.46 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  24.88 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.03 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  24.88 
 
 		 456 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  29.14 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  24.29 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.89 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  24.73 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  23.08 
 
 		 456 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  21.2 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  25 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  24.54 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  23.04 
 
 		 457 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>