165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 281 aa  566  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  80 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  75.83 
 
 		 243 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  66.53 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  62.3 
 
 		 263 aa  322  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  70 
 
 		 243 aa  321  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  66.12 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  66.25 
 
 		 250 aa  318  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  64.75 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  61 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  62.92 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  61.75 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  61.13 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  60.42 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  60.83 
 
 		 250 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  63.22 
 
 		 243 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  58.94 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  57.54 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  58.92 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  58.92 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  58.92 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  59.11 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  58.94 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  58.61 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  57.55 
 
 		 265 aa  281  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  55.09 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  58.98 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  59.92 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  59.17 
 
 		 243 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  59.29 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  55.6 
 
 		 252 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  54.29 
 
 		 251 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  54.58 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  54.9 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  54.41 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  55.79 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  51.67 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  44.62 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  29.44 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  37.9 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  39.8 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  36.8 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  30.88 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  30.24 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  35.2 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  33.86 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  29.1 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  32.13 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  36.87 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  34.16 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  32.66 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  36.52 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  28.17 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  29.39 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  30.32 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.51 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  31.43 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  31.65 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  25.86 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  25.99 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  37.78 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  41.07 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  27.64 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  27.34 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.53 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  29.84 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.12 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  34.69 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  26.53 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  31.87 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  34.41 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0855  DNA repair protein RecO  32.98 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  29.26 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  30 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>