More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0036 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.67 
 
 
279 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.82 
 
 
272 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.95 
 
 
280 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  41.61 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  39.39 
 
 
812 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  36.99 
 
 
296 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.29 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.76 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.68 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.14 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  38.39 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  38.39 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.6 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.53 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.49 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.49 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  40 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  41.51 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.54 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.74 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1322  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.64 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.14 
 
 
202 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.57 
 
 
171 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.22 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.95 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  32.95 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.95 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  32.95 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.95 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.18 
 
 
183 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.04 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.82 
 
 
198 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  38.46 
 
 
364 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.82 
 
 
198 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.82 
 
 
198 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.66 
 
 
169 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.21 
 
 
198 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  32.65 
 
 
438 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.78 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.97 
 
 
299 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.68 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
438 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.94 
 
 
191 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.6 
 
 
176 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.17 
 
 
222 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  37.29 
 
 
439 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.85 
 
 
199 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.86 
 
 
194 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.12 
 
 
199 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.85 
 
 
216 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.34 
 
 
201 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  28.48 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  28.21 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  29.19 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  37.36 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.05 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.43 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  37.5 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1402  PAP2 family protein  33.33 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.62 
 
 
187 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.48 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  29.52 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.19 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  28.32 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.04 
 
 
199 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.25 
 
 
157 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.78 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0110  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.57 
 
 
176 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.93 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4970  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.49 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.5 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.48 
 
 
227 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.46 
 
 
166 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.81 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.24 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
205 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.14 
 
 
224 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.34 
 
 
202 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.34 
 
 
202 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.29 
 
 
438 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.04 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  32.58 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.62 
 
 
172 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>