289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3316 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56643e-10  hitchhiker  5.16486e-10 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  96.79 
 
 
156 aa  317  4e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.63704e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  96.15 
 
 
156 aa  316  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.70066e-09  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  96.15 
 
 
156 aa  316  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.54968e-07  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  95.51 
 
 
156 aa  315  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  95.51 
 
 
156 aa  314  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  93.59 
 
 
156 aa  310  5e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  92.95 
 
 
156 aa  305  1e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.37083e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  92.31 
 
 
156 aa  304  2e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  90.38 
 
 
156 aa  302  1e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.16859e-08  decreased coverage  2.22893e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  91.03 
 
 
156 aa  301  3e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  91.67 
 
 
156 aa  300  4e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  284  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.32782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
156 aa  263  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
156 aa  262  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
156 aa  259  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.7133e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.08281e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.39477e-07  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.21913e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.08993e-07  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.54252e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 
155 aa  256  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.37947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  255  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  255  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  254  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
155 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
155 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  3.02367e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
155 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
155 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 
155 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  76.28 
 
 
156 aa  252  1e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 
156 aa  252  1e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.84125e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  75 
 
 
156 aa  251  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  250  5e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  78.62 
 
 
145 aa  245  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 
155 aa  244  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  71.79 
 
 
156 aa  243  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  70.51 
 
 
156 aa  238  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  69.23 
 
 
156 aa  235  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  54.84 
 
 
155 aa  201  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  58.71 
 
 
155 aa  200  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  54.84 
 
 
155 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  54.19 
 
 
156 aa  192  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  54.84 
 
 
155 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  54.84 
 
 
155 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  55.48 
 
 
155 aa  191  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  54.84 
 
 
155 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  54.84 
 
 
155 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  54.84 
 
 
155 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  54.19 
 
 
155 aa  190  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  53.55 
 
 
155 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  53.55 
 
 
155 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  187  6e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  55.13 
 
 
156 aa  182  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  179  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.86318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
155 aa  172  2e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  52.9 
 
 
155 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08380  rRNA large subunit methyltransferase  54.19 
 
 
155 aa  167  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0699075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  50.32 
 
 
156 aa  162  2e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  161  4e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  50.97 
 
 
156 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 
156 aa  160  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  47.74 
 
 
157 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 
156 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  50.32 
 
 
156 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  50.32 
 
 
156 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 
156 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
156 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  49.36 
 
 
155 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  156  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  48.72 
 
 
155 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  48.72 
 
 
155 aa  154  5e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  48.72 
 
 
155 aa  153  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  47.47 
 
 
159 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  49.36 
 
 
156 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>