More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2616 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.04189e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.54481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.28192e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  8.83945e-10  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  97.28 
 
 
184 aa  360  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.64279e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  95.63 
 
 
183 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.37286e-09  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  95.63 
 
 
183 aa  352  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.45159e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 
183 aa  350  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  8.91458e-06  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  95.03 
 
 
181 aa  345  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  82.61 
 
 
184 aa  315  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  2.99091e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  83.98 
 
 
181 aa  312  2e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  1.18045e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  82.51 
 
 
183 aa  311  5e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  81.52 
 
 
197 aa  307  6e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.33357e-08  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  80.33 
 
 
185 aa  306  1e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.68696e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  79.56 
 
 
182 aa  303  1e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  6.07797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  79.56 
 
 
181 aa  301  3e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  80 
 
 
181 aa  298  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.00234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  78.89 
 
 
181 aa  289  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  78.33 
 
 
181 aa  287  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  77.22 
 
 
181 aa  285  3e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  74.59 
 
 
187 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  74.32 
 
 
198 aa  274  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  1.92445e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  74.59 
 
 
187 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  74.18 
 
 
187 aa  274  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  71.91 
 
 
182 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  70.39 
 
 
182 aa  258  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  68.36 
 
 
178 aa  256  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 
185 aa  255  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  71.68 
 
 
185 aa  252  2e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
183 aa  251  4e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
183 aa  250  9e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
183 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
181 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  67.05 
 
 
174 aa  246  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
183 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
183 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
183 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  67.58 
 
 
183 aa  243  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  65.71 
 
 
178 aa  241  4e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  67.03 
 
 
183 aa  241  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
181 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
175 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
181 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
181 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
179 aa  199  2e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
179 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
199 aa  197  8e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
181 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
181 aa  196  1e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
181 aa  196  1e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
178 aa  196  2e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
181 aa  196  2e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
178 aa  194  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
181 aa  194  8e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
175 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 
181 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
181 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
181 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
178 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 
181 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
173 aa  191  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
180 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
179 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
177 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
180 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
177 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
175 aa  189  3e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
179 aa  188  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
179 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
187 aa  185  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
176 aa  185  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
179 aa  184  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
177 aa  183  1e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
180 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
196 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
171 aa  180  8e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.50543e-07  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
173 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
186 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  54.78 
 
 
172 aa  178  3e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
184 aa  177  6e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
190 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
181 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
186 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
170 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.9573e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
184 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
231 aa  175  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
171 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
202 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
202 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
170 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.36015e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
172 aa  174  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
172 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>