263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1942 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1942  NUDIX hydrolase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.58411e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2377  NUDIX hydrolase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.54779e-06  normal  0.335752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1916  NUDIX hydrolase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.91981e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  87.18 
 
 
195 aa  355  2e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.03843e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  86.67 
 
 
195 aa  353  8e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.60151e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  86.67 
 
 
195 aa  352  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  85.05 
 
 
195 aa  342  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1805  NUDIX hydrolase  89.18 
 
 
194 aa  333  6e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000497318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  62.11 
 
 
200 aa  251  4e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  63.49 
 
 
191 aa  246  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  65.45 
 
 
197 aa  243  1e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.90793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  56.76 
 
 
202 aa  220  1e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
189 aa  218  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  58.42 
 
 
189 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
189 aa  210  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  48.52 
 
 
244 aa  155  5e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  47.85 
 
 
168 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  47.85 
 
 
168 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
207 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  43.23 
 
 
191 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 
216 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
198 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  40.82 
 
 
197 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  46.88 
 
 
190 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 
245 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  46.47 
 
 
226 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
207 aa  147  1e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 
194 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
216 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  47.62 
 
 
227 aa  145  4e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  41.4 
 
 
211 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
211 aa  144  7e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
210 aa  144  7e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
243 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 
228 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
225 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
228 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
228 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
228 aa  139  2e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
221 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
228 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
214 aa  139  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
228 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
235 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  38.71 
 
 
199 aa  139  4e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
228 aa  138  5e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.73 
 
 
483 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  41.44 
 
 
238 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 
199 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
195 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 
235 aa  135  3e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
221 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
237 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  44.71 
 
 
202 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
239 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
427 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
234 aa  134  7e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
234 aa  134  7e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
217 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
197 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
427 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
217 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
199 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 
199 aa  134  1e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
242 aa  133  1e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.88 
 
 
333 aa  134  1e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
227 aa  133  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
202 aa  133  1e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
210 aa  133  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 
199 aa  131  7e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
221 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  38.59 
 
 
199 aa  130  1e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.97 
 
 
347 aa  129  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  40.61 
 
 
192 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
244 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  44.24 
 
 
195 aa  129  4e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
222 aa  129  4e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 
195 aa  128  5e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  42.42 
 
 
192 aa  128  5e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
221 aa  127  7e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
220 aa  127  1e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  37.69 
 
 
204 aa  125  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.37822e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  40 
 
 
204 aa  125  4e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
242 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
235 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  41.98 
 
 
199 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  41.98 
 
 
199 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  41.98 
 
 
199 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
227 aa  124  8e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
226 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  46.01 
 
 
218 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
214 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
223 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.95 
 
 
217 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  39.57 
 
 
192 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>