43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  31.71 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  28.36 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.75 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  30.34 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  27.56 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  25.49 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  31.37 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  24 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  30.39 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  28.46 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  21.83 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  33.75 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.17 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  33.75 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.75 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  30.86 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  32.1 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  24.24 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  27.05 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  28.24 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  27.84 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  48.84 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  48.84 
 
 		 121 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  26.67 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  38.6 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  26.97 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  28.43 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  43.4 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  25.98 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  25.74 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  48.72 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  23.68 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  47.62 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>