More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3549 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  920    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.27 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  50.86 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  49.89 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.88 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.02 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.25 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.67 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.91 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.27 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.81 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.78 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.41 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.06 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.41 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.28 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.6 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.31 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.82 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.6 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.94 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.69 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.91 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.34 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.41 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.38 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.31 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.51 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.51 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.75 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.31 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.91 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.91 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  45.67 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  46.83 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.6 
 
 		 468 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.1 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.12 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.94 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.16 
 
 		 466 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.16 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.24 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.15 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.32 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.77 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.97 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.29 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.29 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.02 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.93 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.93 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.39 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.83 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.71 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  44.52 
 
 		 468 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.64 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.78 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 475 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.87 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.69 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.02 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.17 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.77 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  46.86 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.09 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.99 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.87 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>