More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0402 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  57.27 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  53.23 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  50.81 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  48.82 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  52.5 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  53.11 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  44.44 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  50.59 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  48.96 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  47.39 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  46.28 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  45.38 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  51.4 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  43.87 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  47.9 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  46.25 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  50.67 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  47.2 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  49.78 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  47.2 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  45.1 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  51.14 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  41.9 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  44.84 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  45.82 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  45.82 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  44.27 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  50.68 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  46.59 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  44.76 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  49.77 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  45.97 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  45.97 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  45.97 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  43.82 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  43.82 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  44.98 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  43.82 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  45.06 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  43.82 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  43.8 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  48.83 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  43.87 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  43.87 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  43.87 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  43.87 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  43.87 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  44.05 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  47.49 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  46.82 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  43.87 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  46.61 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  46.61 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  45.31 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  43.2 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  44.44 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  44.44 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  46.01 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  45.24 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  42.75 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  43.7 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  47.14 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  43.08 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  45.56 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  46.88 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  46.12 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  43.55 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  44.58 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  43.65 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  49.07 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  44.66 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  44.19 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  45.27 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  48.65 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  43.44 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  45.07 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  43.44 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  45.07 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  44.66 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  44.27 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  44.35 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>