56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0565 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  88.5 
 
 		 226 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  81.78 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  81.78 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  81.78 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  81.78 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  81.78 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  80.89 
 
 		 226 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  82.22 
 
 		 226 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  78.22 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  67.7 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  66.81 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  65.93 
 
 		 228 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  66.52 
 
 		 225 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  63.72 
 
 		 226 aa  303  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  60.62 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  59.73 
 
 		 226 aa  285  5.999999999999999e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  66.67 
 
 		 195 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  54.22 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  52.44 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  53.36 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  52.91 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  49.08 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  52.91 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  49.55 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  50.45 
 
 		 226 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.75 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  46.85 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  45.16 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  43.11 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.45 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  30.22 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  25.99 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  28.96 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  27.23 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  24.53 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  25.12 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  26.01 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  26.01 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  24.4 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  26.01 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  24.54 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  23.74 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  24.26 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.12 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  20.93 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  22.01 
 
 		 214 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  21.08 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>