More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0855 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  53.02 
 
 
637 aa  685  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  74.43 
 
 
618 aa  969  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.90878e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  54.62 
 
 
643 aa  721  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  78.18 
 
 
618 aa  1046  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  50.96 
 
 
638 aa  660  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.6113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  50.57 
 
 
628 aa  649  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  72.61 
 
 
610 aa  978  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  77.69 
 
 
618 aa  1036  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.00115e-07  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
618 aa  1279  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.72636e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  78.01 
 
 
618 aa  1048  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  78.01 
 
 
618 aa  1039  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  78.01 
 
 
618 aa  1039  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.94498e-05  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  78.18 
 
 
618 aa  1046  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  78.18 
 
 
618 aa  1046  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  77.85 
 
 
618 aa  1036  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  78.18 
 
 
618 aa  1046  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.42864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.56 
 
 
641 aa  657  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  51.37 
 
 
638 aa  655  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  74.27 
 
 
618 aa  1001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.5861e-05  unclonable  1.00578e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  77.85 
 
 
618 aa  1040  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.24923e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  74.51 
 
 
627 aa  1001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  50.72 
 
 
652 aa  660  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  72.35 
 
 
610 aa  956  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  4.26063e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  49.59 
 
 
633 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  49.35 
 
 
634 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  48.46 
 
 
633 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  48.46 
 
 
633 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  48.46 
 
 
633 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  48.46 
 
 
633 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.20235e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  49.02 
 
 
634 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  48.46 
 
 
633 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49016e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.4384e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.14363e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.71681e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.10034e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.98209e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  48.94 
 
 
633 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  48.71 
 
 
632 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  49.84 
 
 
631 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  49.51 
 
 
631 aa  615  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  49.67 
 
 
631 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  50 
 
 
631 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  49.51 
 
 
634 aa  613  1e-174  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  49.19 
 
 
625 aa  615  1e-174  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  49.35 
 
 
636 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  46.63 
 
 
637 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  44.7 
 
 
629 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  44.54 
 
 
629 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  44.54 
 
 
629 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  44.54 
 
 
629 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  44.86 
 
 
631 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  45.54 
 
 
641 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  44.35 
 
 
630 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  45.51 
 
 
631 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  45.35 
 
 
631 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  44.84 
 
 
646 aa  540  1e-152  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  44.37 
 
 
630 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  44.28 
 
 
621 aa  533  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  44.26 
 
 
623 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  44.35 
 
 
646 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  44.26 
 
 
623 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.81771e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  44.26 
 
 
623 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  2.0031e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  44.26 
 
 
623 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.25085e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  44.26 
 
 
623 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  43.49 
 
 
630 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  43.41 
 
 
667 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  43.51 
 
 
629 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
618 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  43.34 
 
 
629 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  43.41 
 
 
631 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  42.18 
 
 
632 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  42.39 
 
 
633 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.73 
 
 
640 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  43.25 
 
 
655 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  43.11 
 
 
612 aa  518  1e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.64685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  44.75 
 
 
619 aa  516  1e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  42.95 
 
 
615 aa  516  1e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  43.69 
 
 
626 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  41.4 
 
 
645 aa  507  1e-142  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  43.65 
 
 
646 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  42.81 
 
 
611 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  44.52 
 
 
617 aa  493  1e-138  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  44.7 
 
 
617 aa  494  1e-138  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  43.19 
 
 
630 aa  492  1e-138  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  41.65 
 
 
626 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  2.41166e-07 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  41.76 
 
 
678 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  41.91 
 
 
673 aa  482  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  43.07 
 
 
664 aa  478  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
662 aa  478  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  42.11 
 
 
607 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  41.32 
 
 
627 aa  471  1e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 
640 aa  469  1e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  41.71 
 
 
760 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  40.23 
 
 
703 aa  467  1e-130  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  39.84 
 
 
636 aa  467  1e-130  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
765 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
765 aa  466  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>