More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1507 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  54.63 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  50.71 
 
 
225 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  42.79 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  44.93 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  41.06 
 
 
230 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.9 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  46.83 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  41.55 
 
 
228 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 
225 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  41.06 
 
 
225 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  40.1 
 
 
210 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  45.36 
 
 
211 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  44.9 
 
 
211 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  44.9 
 
 
211 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.38 
 
 
224 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  40.98 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.35 
 
 
209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.35 
 
 
209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  40.38 
 
 
236 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  37.68 
 
 
255 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  40.45 
 
 
267 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  41.01 
 
 
267 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  37.82 
 
 
255 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  39.42 
 
 
227 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.52 
 
 
213 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  38.73 
 
 
218 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
214 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  42.19 
 
 
787 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  37.44 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.71 
 
 
234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  36.19 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 
200 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  36.32 
 
 
248 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  39.32 
 
 
216 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  35.71 
 
 
211 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.02 
 
 
230 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  36.95 
 
 
219 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  35.38 
 
 
213 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  39.02 
 
 
222 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  34.12 
 
 
235 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  39.11 
 
 
356 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  36.95 
 
 
219 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 
258 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  36.49 
 
 
218 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  35.44 
 
 
219 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  35.85 
 
 
225 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  38.39 
 
 
210 aa  148  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.12 
 
 
251 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  36.23 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  40 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  39.35 
 
 
284 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.1 
 
 
242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  37.44 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  37.44 
 
 
220 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  36.06 
 
 
213 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  35.1 
 
 
213 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  37.98 
 
 
278 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  35.44 
 
 
213 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  37.56 
 
 
242 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  34.91 
 
 
214 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
219 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  34.13 
 
 
219 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  35.58 
 
 
214 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  36.97 
 
 
217 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  34.29 
 
 
216 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
219 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  33.03 
 
 
230 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  37.07 
 
 
242 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  35.92 
 
 
230 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.71 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  34.3 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  34.78 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  35.61 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  34.78 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.78 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  33.65 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  36.23 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  33.49 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  34.12 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
246 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  32.7 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  36.1 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  34.63 
 
 
214 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  34.58 
 
 
238 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  36.41 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  35.44 
 
 
225 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>