86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0339 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
137 aa  287  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  32.58 
 
 
284 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  31.78 
 
 
151 aa  67.4  6e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80657e-07 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  27.41 
 
 
140 aa  63.5  9e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  27.13 
 
 
144 aa  62.4  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  23.53 
 
 
145 aa  62.8  2e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  23.53 
 
 
145 aa  62.8  2e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  27.91 
 
 
144 aa  62.4  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  62  3e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  38.75 
 
 
142 aa  61.6  4e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
138 aa  61.2  4e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 
138 aa  61.6  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  28.91 
 
 
145 aa  60.8  6e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  26.36 
 
 
286 aa  60.1  9e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 
132 aa  60.1  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  26.36 
 
 
286 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  26.36 
 
 
286 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 
144 aa  58.9  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 
149 aa  56.6  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  55.5  3e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  24.46 
 
 
139 aa  55.1  4e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  27.56 
 
 
182 aa  53.5  9e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  29.21 
 
 
150 aa  53.1  1e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.30917e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 
181 aa  52.4  2e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 
148 aa  52.4  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.47367e-08  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  31.87 
 
 
138 aa  52  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  31.18 
 
 
214 aa  52  3e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  51.2  4e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  22.95 
 
 
139 aa  50.4  8e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  24.03 
 
 
146 aa  50.4  9e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0822  hypothetical protein  23.89 
 
 
153 aa  49.7  1e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.47066  unclonable  9.65706e-06 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  25.21 
 
 
163 aa  49.7  1e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2486  hypothetical protein  23.68 
 
 
143 aa  50.1  1e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.183485  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0305  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  49.7  1e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.420122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.93 
 
 
152 aa  48.9  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  25.78 
 
 
186 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0076  response regulator receiver protein  24 
 
 
242 aa  49.3  2e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.56 
 
 
157 aa  48.9  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  26.83 
 
 
128 aa  48.9  3e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4972  hypothetical protein  44 
 
 
65 aa  48.5  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108578  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 
180 aa  48.1  4e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 
139 aa  48.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  31.82 
 
 
127 aa  48.1  4e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25.78 
 
 
137 aa  47.8  5e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  25.83 
 
 
138 aa  47.8  6e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.78 
 
 
123 aa  47.4  7e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  25.35 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  24 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  30.26 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  25.18 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  27.12 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  26.37 
 
 
135 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  27.05 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  23.85 
 
 
242 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  23.4 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  24.79 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  27.59 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.77 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  27.13 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  30.68 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  27.91 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  30.38 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  24.06 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  24.18 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4298  hypothetical protein  27.42 
 
 
392 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.58 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  23.44 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02562  hypothetical protein  23.77 
 
 
324 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  29.67 
 
 
179 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  21.48 
 
 
141 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  6.75641e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  24.06 
 
 
185 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  23.39 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  22.86 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  8.49743e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  23.6 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.67 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  22.41 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  29.67 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 
155 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  28.57 
 
 
179 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.66545e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>