222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0128 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
301 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  49.49 
 
 
294 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  45.3 
 
 
302 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  45.42 
 
 
307 aa  236  4e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  41.16 
 
 
306 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  41.96 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.66 
 
 
308 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  39.8 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  38.05 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  38.87 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  38.05 
 
 
303 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  38.79 
 
 
286 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  38.05 
 
 
303 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  38.05 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  38.05 
 
 
303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  38.05 
 
 
303 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 
302 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 
302 aa  168  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  37.37 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  38.95 
 
 
319 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  37.04 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  37.04 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  39.22 
 
 
292 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  37.98 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  37.28 
 
 
294 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  37.76 
 
 
293 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  39.07 
 
 
296 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  32.01 
 
 
299 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  33.77 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 
301 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
315 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  33.11 
 
 
295 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  34.56 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.6 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  33.79 
 
 
307 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  27.74 
 
 
310 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  30.9 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.54 
 
 
289 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30 
 
 
298 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.42 
 
 
295 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  31.87 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  31.87 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
296 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  32.06 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  32.78 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  28.67 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  28.48 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
308 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  28.15 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  33.21 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  33.21 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.85 
 
 
305 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  30.38 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  30.14 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  30.3 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  30.07 
 
 
312 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  31.52 
 
 
304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
295 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  30.55 
 
 
299 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  29.62 
 
 
297 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  30.49 
 
 
312 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
290 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  29.09 
 
 
296 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.29 
 
 
295 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.51 
 
 
288 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
296 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  30.46 
 
 
298 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25.24 
 
 
336 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  31.01 
 
 
288 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  30.8 
 
 
309 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  26.83 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
313 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  28.72 
 
 
311 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  28.08 
 
 
309 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  29.27 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  28.08 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30.58 
 
 
308 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 
302 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  29.28 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  28.22 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  28.95 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  28.72 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>