More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1622 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  100 
 
 		 329 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  59.68 
 
 		 349 aa  384  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  57.28 
 
 		 326 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  56.87 
 
 		 326 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  54.09 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  55.1 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.16 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.19 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.55 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.26 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.87 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.42 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  52.88 
 
 		 321 aa  341  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  53.53 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  47.84 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  49.68 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  53.82 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  50 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  48.26 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  50.34 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  48.34 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  50 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  49.15 
 
 		 360 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  50 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  51.19 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  47.45 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  48.99 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  43.87 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  45.14 
 
 		 378 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  46.41 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  47.08 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  47.08 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  47.08 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  49.5 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  44.63 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  44.63 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  50 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  49.49 
 
 		 311 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  47.96 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  46.38 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  49.12 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  49.12 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  49.12 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  49.12 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  50.17 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  49.12 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  45.35 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  46.18 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  49.1 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  46.5 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.39 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  45.79 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  47.32 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  42.46 
 
 		 351 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  53.5 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  49.16 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  49.16 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  44.79 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.69 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.46 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  47.3 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  52.42 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  46.95 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  47.06 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.41 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.13 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  42.18 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  43.12 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  40.79 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  40.46 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.17 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  38.17 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  48.06 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  47.09 
 
 		 288 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  49.49 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  46.15 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  46.38 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  46.12 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  40.91 
 
 		 300 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  45.33 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  45.33 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  46.05 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  43.8 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  44.02 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  40.68 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  41.3 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  48.91 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  41.7 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  49.7 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  39.75 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  47.85 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  43.93 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  38.65 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  46.45 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  45.83 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  47.22 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  44.32 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  38.22 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  42.52 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>