More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2889 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
209 aa  430  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  51.44 
 
 
211 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  49.04 
 
 
208 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.87 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  48.33 
 
 
208 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 
205 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  50 
 
 
210 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
210 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 
211 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  43.65 
 
 
207 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
213 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  46.15 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.28 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  44.55 
 
 
213 aa  161  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.19 
 
 
214 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.91 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  40.21 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.41 
 
 
219 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.51 
 
 
219 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  36.97 
 
 
213 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.54 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  34.69 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  34.12 
 
 
213 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.28 
 
 
215 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  31.6 
 
 
214 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 
201 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  36.92 
 
 
211 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 
211 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.7 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  36.17 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.18 
 
 
207 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 
203 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  32.84 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.74 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  30.92 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  29.7 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31.4 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  30.93 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.71 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  34.32 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.88 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.39 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  30.69 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  27.18 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  27.94 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  33.01 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  29.65 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  29.61 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  28.4 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  31.25 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  29.21 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  28.96 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  28.91 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  28.79 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  26.83 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  26 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  30.06 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  32.28 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  27.59 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32.54 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  30.18 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  27.4 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  28.43 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  27.15 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>