More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1352 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  92.31 
 
 		 104 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  67.31 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  66.35 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  75 
 
 		 104 aa  129  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  59.62 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  64.42 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  60.58 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  58.82 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  58.82 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  61.76 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  50.96 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  50 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  50 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  47.06 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  41.35 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  47.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  49.02 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  51.46 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  46.08 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  46.08 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  42.31 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  50.96 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>