More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2464 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.45 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  65.97 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  65.97 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  65.97 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  65.97 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  64.4 
 
 		 197 aa  253  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  64.4 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  64.4 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  64.4 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  67.04 
 
 		 197 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  61.83 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  55.81 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.88 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  49.12 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  47.02 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  51.3 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  45.73 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  47.24 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  50.31 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  47.24 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.56 
 
 		 171 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  43.9 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  46.34 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  46.34 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  46.63 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  46.63 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  48.45 
 
 		 167 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  47.31 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  48.45 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  44.85 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.24 
 
 		 166 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  46.2 
 
 		 171 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  44.38 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  47.1 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  46.63 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  41.46 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  44.77 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  44.77 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.38 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  43.64 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  44.58 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  44.12 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  43.98 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  44.05 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  45.16 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  46.1 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  43.37 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  45.81 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  45.68 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.71 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  40.94 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  43.98 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  44.85 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  42.86 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  42.86 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  41.86 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  43.11 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  39.39 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  43.93 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  43.98 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  41.86 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  41.36 
 
 		 175 aa  138  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.86 
 
 		 166 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  41.1 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  44.31 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  44.03 
 
 		 167 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.86 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  43.86 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  42.44 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  46.06 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  41.61 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  42.17 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.94 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  42.17 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.92 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  45.51 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  42.44 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  41.86 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  43.64 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  43.27 
 
 		 165 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.57 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.39 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.44 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>