More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0933 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.82 
 
 
680 aa  714    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  60.12 
 
 
698 aa  793    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
668 aa  1367    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.68 
 
 
688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  46.48 
 
 
717 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
687 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
687 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  44.2 
 
 
687 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.05 
 
 
687 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.2 
 
 
683 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.2 
 
 
683 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 
683 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.2 
 
 
683 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.26 
 
 
682 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.39 
 
 
686 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.24 
 
 
687 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.74 
 
 
692 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  44.38 
 
 
713 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  44.9 
 
 
684 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.08 
 
 
683 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.01 
 
 
684 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.44 
 
 
700 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.95 
 
 
709 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.88 
 
 
720 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.88 
 
 
684 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.21 
 
 
685 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  38.26 
 
 
695 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.21 
 
 
688 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.03 
 
 
674 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  38 
 
 
674 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.33 
 
 
674 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.39 
 
 
687 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  33.53 
 
 
648 aa  352  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  37.29 
 
 
750 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.6 
 
 
675 aa  321  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  31.82 
 
 
729 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  31.41 
 
 
722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.9 
 
 
633 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  30.45 
 
 
688 aa  276  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 
673 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.97 
 
 
633 aa  266  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.87 
 
 
675 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  29.14 
 
 
675 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.38 
 
 
675 aa  257  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.36 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.12 
 
 
673 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.12 
 
 
698 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 
681 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 
681 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.7 
 
 
681 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
690 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 
681 aa  248  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.78 
 
 
680 aa  234  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.09 
 
 
672 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.33 
 
 
700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.46 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.57 
 
 
666 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.57 
 
 
666 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.57 
 
 
666 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.46 
 
 
694 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.94 
 
 
668 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.57 
 
 
688 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.49 
 
 
704 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.13 
 
 
673 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.59 
 
 
668 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.92 
 
 
695 aa  194  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.87 
 
 
680 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26 
 
 
652 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.41 
 
 
678 aa  190  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 
695 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.65 
 
 
721 aa  184  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.29 
 
 
661 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
709 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.27 
 
 
717 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.68 
 
 
720 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.13 
 
 
667 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
686 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.82 
 
 
716 aa  174  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.68 
 
 
708 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.92 
 
 
766 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.26 
 
 
677 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 
670 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.73 
 
 
697 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
692 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.19 
 
 
692 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  36.6 
 
 
719 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.29 
 
 
726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.31 
 
 
762 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.98 
 
 
626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.3 
 
 
660 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.88 
 
 
682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.46 
 
 
617 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.11 
 
 
664 aa  137  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  26.32 
 
 
704 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.96 
 
 
701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 
701 aa  131  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.13 
 
 
712 aa  130  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.66 
 
 
623 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  23.53 
 
 
656 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  23.2 
 
 
656 aa  128  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>