More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4634 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  92.69 
 
 		 438 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  100 
 
 		 438 aa  890    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  91.32 
 
 		 438 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  79.26 
 
 		 436 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  91.78 
 
 		 438 aa  830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  92.07 
 
 		 429 aa  820    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  78.44 
 
 		 436 aa  737    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  72.37 
 
 		 438 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  79.31 
 
 		 440 aa  737    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  76.61 
 
 		 438 aa  699    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  76.15 
 
 		 436 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  95.66 
 
 		 438 aa  856    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  95.21 
 
 		 438 aa  854    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  94.98 
 
 		 438 aa  852    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  77.06 
 
 		 446 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  56.12 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  50.82 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  49.2 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 447 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  43.96 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  43.96 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  44.7 
 
 		 470 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  44.34 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  44.34 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  43.74 
 
 		 450 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  44.11 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  43.38 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  42.96 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  46.19 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  43.42 
 
 		 438 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  44.7 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  42.14 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  41.91 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  42.46 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  42.76 
 
 		 459 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  40.29 
 
 		 440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  36.69 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  34.62 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  34.16 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  39.29 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  37.68 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.49 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  33.18 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  35.29 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  41.73 
 
 		 445 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  39.55 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  33.18 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  40.65 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  32.35 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  40.7 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  33.33 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  33.05 
 
 		 522 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.81 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 509 aa  173  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  35.44 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  34.85 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>