135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2037 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  86.82 
 
 		 258 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  86.82 
 
 		 258 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  47.04 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  46.77 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  46.77 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  46.77 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  46.77 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  46.77 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  43.92 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  44.72 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.5 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  43.44 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.09 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  38.1 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  35.59 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  36.7 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  34.01 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  35.71 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  34.13 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  32.54 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  31.89 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  29.18 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  28.15 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  32.75 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  32.86 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  32.86 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  0.0000000053706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  28.29 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  29.25 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  31.44 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  31.63 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  34.02 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  31 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  30.6 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  30.99 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  32.46 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  32.46 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  28.81 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  29.46 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  29.82 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  31.14 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  29.37 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  30.67 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  25.49 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  27.69 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  30.12 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  29.89 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  25.7 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  28.38 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  28.39 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  30.54 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  29.29 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  29.96 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  27.57 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  32.87 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  27.87 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  27.87 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  27.87 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  26.85 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  28.89 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  29.32 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  30.57 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  27.05 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  27.06 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  31.78 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  27.16 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  27.35 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  33.06 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  29.2 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  28.35 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  30.13 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  27.13 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  29.1 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>