More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1243 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  95.45 
 
 
66 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  95.45 
 
 
66 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  74.19 
 
 
66 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  70.97 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 
66 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  60 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  60.32 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  70.1  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  54.39 
 
 
57 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
63 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  51.61 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  60.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.94 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>