221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0303 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  789    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  85.3 
 
 
388 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  61.46 
 
 
384 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  55.12 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  56.58 
 
 
377 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  53.33 
 
 
379 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  53.6 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  53.02 
 
 
380 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  53.07 
 
 
381 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  53.07 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  53.33 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  52.8 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  50 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  49.35 
 
 
384 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  48.68 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  49.2 
 
 
379 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  48.93 
 
 
377 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  46.09 
 
 
390 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  47.63 
 
 
384 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  46.32 
 
 
381 aa  348  9e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  46.32 
 
 
381 aa  348  9e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  46.93 
 
 
378 aa  345  8e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  46.95 
 
 
379 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  45.55 
 
 
400 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  47.49 
 
 
378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  45.65 
 
 
382 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  45.77 
 
 
375 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  45.77 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  45.21 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  43.49 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  40.53 
 
 
375 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  39.52 
 
 
371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  35.39 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  33.6 
 
 
375 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  35.12 
 
 
376 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  33.6 
 
 
389 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  31.18 
 
 
391 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  33.84 
 
 
403 aa  207  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  32.35 
 
 
375 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  32.35 
 
 
375 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.27 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  30.83 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  31.99 
 
 
385 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.59 
 
 
738 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  30.48 
 
 
393 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  32.8 
 
 
340 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  30.91 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.88 
 
 
708 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  32.44 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.31 
 
 
730 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.22 
 
 
749 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.31 
 
 
730 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.67 
 
 
713 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
702 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
702 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
702 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
702 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.31 
 
 
730 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.3 
 
 
702 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.38 
 
 
711 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
711 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  31.12 
 
 
387 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.81 
 
 
702 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  31.01 
 
 
702 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  31.01 
 
 
702 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.01 
 
 
702 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.95 
 
 
721 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  31.01 
 
 
702 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.01 
 
 
702 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.01 
 
 
702 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.69 
 
 
725 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.39 
 
 
711 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 
706 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 
706 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 
706 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.81 
 
 
702 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.53 
 
 
702 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.53 
 
 
730 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.18 
 
 
712 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.99 
 
 
705 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.09 
 
 
725 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  29.79 
 
 
762 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.53 
 
 
750 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 
707 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.21 
 
 
706 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.85 
 
 
711 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  31.13 
 
 
375 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.74 
 
 
702 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.05 
 
 
756 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.81 
 
 
718 aa  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.97 
 
 
709 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.5 
 
 
705 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.46 
 
 
738 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.37 
 
 
701 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>