More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0495 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
327 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
289 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
289 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
293 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  41.1 
 
 
340 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 
327 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
320 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
311 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
296 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
329 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 
305 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
318 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
299 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
301 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
298 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
300 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
297 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
297 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.25 
 
 
297 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  31.23 
 
 
318 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.81 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.26 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  35.86 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
290 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
421 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
305 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
292 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  29.13 
 
 
292 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  26.73 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.19 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
274 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
300 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  29.05 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
290 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
293 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1561  hypothetical protein  23.89 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.45 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  30.54 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  29.65 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3066  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3054  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.365502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  25.58 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.04 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  28.5 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  33.16 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2991  hypothetical protein  23.84 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  32.2 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  25.27 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  26.04 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.2 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>