39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0734 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  306  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  50.38 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  42.34 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  34.56 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  40.2 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  42.27 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  35.42 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  36.73 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  33.05 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  32.33 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2079  hypothetical protein  26.24 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  39 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  31.58 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  32.48 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  26.24 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  30.53 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  32.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  28.47 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  30.53 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  29.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0874  thioesterase-like protein  25.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00486903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 152 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>