35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1520 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
133 aa  266  7e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  29.82 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  31.82 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  32.11 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  29.91 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  29.91 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  29.09 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  39.24 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  26.45 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
152 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  31.07 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  24.76 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  24.37 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  32.48 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 
142 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  32.98 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  28.89 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  27.78 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  30.39 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  27.84 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>