32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0552 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 128 aa  241  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  62.18 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  64.1 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  53.23 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  48.82 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  41.8 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  33.61 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  37.27 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  41.41 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  49.18 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  42.02 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  37.3 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  34.44 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  35.59 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  33.02 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  34.44 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  35.56 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  33.07 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  30.95 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 131 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>