28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3050 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  257  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  58.12 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  47.75 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  48.7 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  48.82 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  43.36 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  34.23 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  37.31 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  38.05 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  35.29 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  31.86 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  32.56 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  29.67 
 
 		 142 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  26.89 
 
 		 149 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>