42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2252 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  56.15 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  55.81 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  54.33 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  48.36 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  48.57 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  43.85 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  37.12 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  37.41 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  43.3 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  35.66 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  38.74 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  38.98 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  35.54 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  35.59 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  32.28 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  28.87 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  31.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  28.15 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  27.91 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0355  thioesterase-like protein  29.41 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0337  thioesterase-like protein  29.13 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0874  thioesterase-like protein  27.27 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00486903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  26.05 
 
 		 135 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>