35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1291 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  87.79 
 
 		 131 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  68.46 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  58.59 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  31.36 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  35.42 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  30.33 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  32.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  34.68 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  26.36 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  29.84 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  24.19 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  30.4 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  32.95 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  26.98 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  26.89 
 
 		 134 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>