38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3802 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  46.56 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  46.62 
 
 
142 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  42.11 
 
 
129 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  38.93 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  40.44 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  40.15 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  38.68 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  44.44 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  38.76 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  46.39 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  43.56 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  36.26 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  39.78 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  30.25 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  36.63 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  34.68 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  33.33 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  29.01 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  25.41 
 
 
144 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  29.92 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  22.83 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>