19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2156 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  100 
 
 
139 aa  285  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  57.14 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  53.96 
 
 
147 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  51.85 
 
 
147 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  33.06 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  35.54 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  37.62 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  32.81 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  29.92 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  31.11 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  29.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  26.67 
 
 
130 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  28.89 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  27.78 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>