21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1901 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  51.85 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  45.83 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  45.14 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  38.52 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  40.23 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  29.55 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  38.54 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  28.24 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  29.92 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  34.02 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  30.4 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  33.94 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 		 89 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  27.83 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>