35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3033 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 152 aa  292  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  83.21 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  58.12 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  62.18 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  49.19 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  38.14 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  41.96 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  54.05 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  37.93 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  46.39 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  35.38 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  35.64 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  27.61 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  27.05 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  36.56 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  28.91 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  26.72 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>