34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3259 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  247  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  83.21 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  53.6 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  64.1 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  51.64 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  48.39 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  36.44 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  40.77 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  40.31 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  38.17 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  37.5 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  35.58 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  33.68 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  27.13 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  31.2 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  28.57 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  31.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  26.96 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  27.97 
 
 		 131 aa  43.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>