36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0155 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  295  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  47.1 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  48.53 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  43.28 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  39.1 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  35.46 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  47.42 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  33.83 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  37.78 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  38.95 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  46.58 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  29.29 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  28.57 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  37.08 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  35.42 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2079  hypothetical protein  25.87 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  27.01 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  28.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  32.61 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  30.71 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  26.67 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  33.75 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>