More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0397 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 478 aa  967    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  70 
 
 		 460 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  67.92 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  68.9 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  67.26 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  65.37 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  67.79 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  69.4 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  65.86 
 
 		 463 aa  614  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 463 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 		 465 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  66.89 
 
 		 463 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  69.64 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  65.5 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  65.18 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  65.66 
 
 		 465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  66.37 
 
 		 463 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  65.7 
 
 		 473 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  63.97 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 		 465 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  63.6 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  63.19 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  65.3 
 
 		 465 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  64.16 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  63.76 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  65.71 
 
 		 458 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  67.94 
 
 		 466 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  66.44 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  66.89 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  63.7 
 
 		 493 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  64.38 
 
 		 466 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  71.21 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  64.32 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  63.83 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  66 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  61.92 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  57.3 
 
 		 471 aa  559  1e-158  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  57.85 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  63.6 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  57.42 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  56.56 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  56.46 
 
 		 475 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  56.56 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  57.2 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  56.99 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  56.58 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 		 491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  55.93 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  56.21 
 
 		 468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  54.3 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  54.08 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  56.26 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  56.58 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  56.14 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  56.14 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  56.01 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  55.18 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  53.58 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  54.67 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  54.32 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  53.85 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  56.7 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  50.2 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  52.77 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  52.49 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.44 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  52.33 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  52.63 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  52.02 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  51.19 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  52.08 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.99 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  53.52 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  51.19 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  52.55 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  54.93 
 
 		 489 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 		 463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  53.18 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  54.71 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  54.85 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>