84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4756 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
127 aa  252  1e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
127 aa  252  1e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  80.77 
 
 
130 aa  201  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  42.98 
 
 
140 aa  80.9  5e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  47.56 
 
 
178 aa  70.1  9e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  47.56 
 
 
178 aa  70.1  9e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  38.1 
 
 
140 aa  70.1  9e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  40 
 
 
140 aa  68.6  3e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.21 
 
 
187 aa  67.4  6e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
186 aa  65.1  4e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.34 
 
 
186 aa  64.3  5e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  43.66 
 
 
139 aa  62.8  2e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  37.6 
 
 
180 aa  61.6  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  34.09 
 
 
208 aa  61.6  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.39 
 
 
149 aa  61.2  5e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.29 
 
 
163 aa  60.5  8e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  36.36 
 
 
124 aa  60.5  8e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  43.21 
 
 
112 aa  60.5  8e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.15 
 
 
188 aa  59.7  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  31.3 
 
 
206 aa  57.8  5e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.51 
 
 
221 aa  57  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  40.51 
 
 
211 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.51 
 
 
221 aa  56.6  1e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  41.77 
 
 
224 aa  56.6  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  40.51 
 
 
221 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  40.51 
 
 
221 aa  56.6  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  40.51 
 
 
191 aa  56.6  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  40.51 
 
 
164 aa  56.2  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  40.51 
 
 
211 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.31 
 
 
193 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.31 
 
 
193 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.63 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  30.47 
 
 
203 aa  55.5  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  41.67 
 
 
138 aa  55.5  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.26 
 
 
136 aa  54.7  4e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  31.97 
 
 
137 aa  54.7  5e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.25 
 
 
125 aa  53.5  8e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  35.09 
 
 
151 aa  53.5  9e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  35.63 
 
 
127 aa  53.1  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  31.67 
 
 
137 aa  52.8  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  35.96 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  46.88 
 
 
139 aa  51.6  4e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.94 
 
 
133 aa  49.7  1e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  32.58 
 
 
144 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.48 
 
 
121 aa  49.3  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.75 
 
 
146 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  45.9 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.33 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  45.9 
 
 
138 aa  48.5  3e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  32.28 
 
 
147 aa  48.1  4e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  35.71 
 
 
124 aa  48.1  4e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  37.5 
 
 
159 aa  48.1  4e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  43.82 
 
 
111 aa  48.1  4e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.83 
 
 
145 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  29.89 
 
 
129 aa  47.8  6e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.12 
 
 
153 aa  47.4  6e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.97 
 
 
125 aa  47  8e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  34.62 
 
 
146 aa  47.4  8e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  40 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  40.4 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  30.91 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.28 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2956  flagellar biosynthesis protein FliO  42.11 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  31.91 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  33.33 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  35.62 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  39.02 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  44.3 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  38.96 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  44.44 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  32.58 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  44.44 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  33.33 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.42 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4139  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00140577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.91 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.52 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  33.73 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  26.37 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>