65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3798 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  100 
 
 
125 aa  238  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
120 aa  228  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  61.98 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  63.46 
 
 
111 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  64.37 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  63.1 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  43.01 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  45.57 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  43 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.36 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  48.31 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  39.82 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.79 
 
 
188 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  41.57 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.31 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  36.89 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  43.53 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  37.93 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  36.63 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  37.93 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  37.93 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  37.93 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.04 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  38.37 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  39.56 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  36.78 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  38.89 
 
 
124 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.73 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.19 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  31.53 
 
 
208 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  46.67 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  34.48 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  34.04 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  34.41 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  43.42 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  37.35 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.1 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.78 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  36.17 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  32.69 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  43.06 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  27.27 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  44.16 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  44.16 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.59 
 
 
193 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.59 
 
 
193 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.33 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  30.69 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  26.36 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.16 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.32 
 
 
152 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  30.1 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  42.19 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  42.19 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  34.44 
 
 
151 aa  40  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>