More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2158 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  59.86 
 
 		 564 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  61.33 
 
 		 542 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  90.29 
 
 		 546 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  69.98 
 
 		 566 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  69.98 
 
 		 566 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  59.16 
 
 		 538 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  69.98 
 
 		 566 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  69.91 
 
 		 568 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  64.88 
 
 		 539 aa  705    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  70.3 
 
 		 566 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  69.41 
 
 		 572 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  69.7 
 
 		 561 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  58.01 
 
 		 561 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  69.05 
 
 		 562 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  69.45 
 
 		 566 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  69.41 
 
 		 572 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  63.84 
 
 		 539 aa  702    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  69.98 
 
 		 566 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  68.24 
 
 		 576 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  69.41 
 
 		 572 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  97.8 
 
 		 545 aa  1045    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  61.12 
 
 		 554 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  69.98 
 
 		 566 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  100 
 
 		 545 aa  1103    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  69.98 
 
 		 609 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  68.59 
 
 		 576 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  61.66 
 
 		 550 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  61.48 
 
 		 554 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  69.98 
 
 		 609 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  59.31 
 
 		 552 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  65.05 
 
 		 559 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  61.19 
 
 		 577 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  58.19 
 
 		 562 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  57.24 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  56.02 
 
 		 538 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  58.77 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.19 
 
 		 535 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  54.41 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  54.6 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  54.6 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  53.38 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  53.37 
 
 		 556 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  52.3 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  54.1 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  55.62 
 
 		 537 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  52.12 
 
 		 542 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  49.73 
 
 		 545 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  51.81 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  52.63 
 
 		 546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  48.91 
 
 		 545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  53.82 
 
 		 549 aa  511  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  53.82 
 
 		 549 aa  511  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  51 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.65 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  49.64 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  48.53 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  48.35 
 
 		 536 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  49.91 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  49.29 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  50.27 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.23 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.74 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  46.55 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.4 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  46.18 
 
 		 567 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  45.36 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  49.38 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  49.21 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  49.29 
 
 		 585 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.22 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  45.28 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  47.13 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  48.31 
 
 		 583 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  47.42 
 
 		 576 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.69 
 
 		 552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  46.95 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  46.4 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  48.28 
 
 		 547 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  47.19 
 
 		 545 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  45.62 
 
 		 557 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  46.17 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  47.06 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  47.14 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  46.38 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  47.32 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.89 
 
 		 576 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  46.26 
 
 		 587 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  46.99 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  45.68 
 
 		 559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  47.43 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  45.05 
 
 		 560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.55 
 
 		 576 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.69 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  45.6 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  46.06 
 
 		 559 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  40.58 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  44.21 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  46.57 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  45.53 
 
 		 567 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>