93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1385 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  91.34 
 
 		 231 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  75.42 
 
 		 242 aa  353  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  66.67 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  67.63 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  57.85 
 
 		 256 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  58.52 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  55.87 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  54.5 
 
 		 214 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  55.02 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  57.69 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  57.69 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  57.69 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  53.59 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  55.36 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  54.47 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  53.66 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  52.2 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  52.68 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  52.68 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  54.29 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  50 
 
 		 217 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  50.24 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  48.8 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  48.57 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  32.06 
 
 		 206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.51 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  30.14 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.84 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  38.62 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  30.65 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  33.15 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  34.85 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  30.95 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  34.52 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  34.67 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.57 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.39 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  30.94 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  29.59 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  29.59 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.86 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  31.37 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  32.88 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  26.88 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  29.44 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  29.19 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  28.43 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  29.61 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.29 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.8 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  32.32 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.04 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  25.91 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  27.72 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  31.94 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.04 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  24.47 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  28.9 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  25.75 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.8 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  23.5 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  21.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  23.29 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  22.63 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.56 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.75 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  23.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.32 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.37 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>