128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0560 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  100 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  77.96 
 
 		 246 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  62.14 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  61.57 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  62.5 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  62.44 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  60 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  61.43 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  59.34 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  59.09 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  58.92 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  63.59 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  59.68 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  65.02 
 
 		 225 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  60.18 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.45 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.64 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  60.36 
 
 		 226 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  60.36 
 
 		 226 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  60.89 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  64.84 
 
 		 228 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  60.27 
 
 		 226 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.87 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.65 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.99 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  55.22 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.07 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.64 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.82 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  61.36 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  57.43 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.16 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  53.88 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  52.91 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  54.46 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  54.05 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  54.5 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.11 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  53.85 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  54.59 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.12 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  52.47 
 
 		 231 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  60.4 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  51.12 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  57.89 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  55.07 
 
 		 599 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  48.82 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  47.67 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  40.81 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  42.11 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  43.28 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  42.03 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  40.81 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.06 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.23 
 
 		 421 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  27.2 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  32.06 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.53 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  34.44 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  37.21 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  35.34 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  34.85 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  34.38 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  31.78 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.9 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.77 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  34.36 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.92 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.62 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  32.52 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.62 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.61 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.94 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  29.88 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  34.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.98 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.19 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.58 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.35 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.21 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  34.85 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.94 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  29.09 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.77 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.43 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.25 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.25 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.25 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.3 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.3 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.05 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.17 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.87 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>