More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2312 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  100 
 
 		 571 aa  1162    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  51.45 
 
 		 546 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  50.63 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.63 
 
 		 556 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  50.82 
 
 		 540 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  49.65 
 
 		 573 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  50.86 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  47.71 
 
 		 560 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  51.56 
 
 		 552 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  48.82 
 
 		 543 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  48.92 
 
 		 567 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  47.76 
 
 		 561 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  47.58 
 
 		 561 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  49.64 
 
 		 557 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  46.64 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  46.64 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  47.83 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  48.04 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  48.67 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  51.71 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  46.94 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  49.46 
 
 		 567 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  46.74 
 
 		 584 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  50.91 
 
 		 543 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.09 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.53 
 
 		 577 aa  475  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.16 
 
 		 566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.91 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  47.3 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  48.3 
 
 		 546 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  47.94 
 
 		 559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  47.83 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.31 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.86 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  46.3 
 
 		 564 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  45.57 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.86 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  45.39 
 
 		 540 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  44.63 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  45.57 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  42.93 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  45.96 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  46.68 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  46.99 
 
 		 552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  45.23 
 
 		 545 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  48.87 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  46.73 
 
 		 553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  46.96 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  45.5 
 
 		 565 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  43.77 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  44.12 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  47.3 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.88 
 
 		 542 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  46.2 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  44.88 
 
 		 542 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  43.81 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.09 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  44.77 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  46.1 
 
 		 583 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  48.07 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  47.93 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  45.13 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  39.22 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  43.93 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  47.97 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  45.68 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  46.62 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  43.98 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  41.93 
 
 		 565 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  42.53 
 
 		 545 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.07 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  46.26 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44.93 
 
 		 541 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  41.46 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  44.35 
 
 		 577 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.75 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  45.65 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.68 
 
 		 538 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  40.55 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  41.29 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  44.21 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  44.79 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  43.59 
 
 		 591 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.05 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  39.68 
 
 		 565 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.81 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.59 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  44.33 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.48 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  44.33 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.43 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  43.49 
 
 		 560 aa  422  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  45.86 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  45.6 
 
 		 545 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.96 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  45.05 
 
 		 564 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.83 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.29 
 
 		 552 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  44.1 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  45.78 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>