233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1716 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.98 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  35.1 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  41.39 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  40.15 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  37.02 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  34.59 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  34.13 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  37.89 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  29.86 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  34.04 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  28.82 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  33.56 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  28.82 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  28.82 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.81 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  28.82 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  28.23 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  33.77 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  32.51 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  30.27 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  30.31 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  36.7 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  33.57 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  29.72 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  29.72 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.55 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  38.29 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  30.31 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  38.43 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  28.98 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  29.86 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  38.55 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  37.59 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  33.7 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  33.67 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.32 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  33.9 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.02 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  30.17 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  29.62 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  34.74 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  29.41 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  31.49 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.13 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.8 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  27.04 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  31.77 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  27.06 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  28.12 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  30.8 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.54 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.59 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  32.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.92 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  30.43 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  30.43 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>