242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0011 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  100 
 
 		 292 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  43.73 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  42.37 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  42.03 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  42.71 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  44.18 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  42.03 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  41.02 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  43 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  42.12 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  41.3 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  44.37 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  39.86 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  42.18 
 
 		 291 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  38.36 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  39.38 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  38.7 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  37.97 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  39.38 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  39.33 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  41.02 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  39 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  41.02 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  41.69 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  38.31 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  39.32 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  40.88 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  35.96 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  39.66 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  38.41 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  36.3 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  35.84 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.67 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  36.95 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  36.03 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  35.03 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  34.69 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  35.57 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  38.93 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  35.23 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  37.79 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  33.79 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  37.67 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  34.11 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  33.67 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  37.33 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  37.04 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  39.04 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  38.98 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  37.67 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  38.91 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  34.35 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  35.96 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  38.69 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  37.41 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  39.39 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  35.27 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  36.73 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  39.67 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  36.05 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  38.01 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  33.79 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  34.25 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  40.74 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  34.9 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  36.3 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  36.52 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  39.6 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  34.24 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  34.93 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  35.27 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.25 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  36.99 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  32.42 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  35.03 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  35.37 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  32.88 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  35.37 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  34.59 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  34.8 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  30.85 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>