180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0074 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  100 
 
 
139 aa  281  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  51.77 
 
 
140 aa  130  8e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  46.43 
 
 
140 aa  123  8e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  46.72 
 
 
138 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  47.1 
 
 
139 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  46.72 
 
 
140 aa  117  5e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  44.2 
 
 
142 aa  115  1e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  45 
 
 
140 aa  116  1e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  41.91 
 
 
137 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  44.29 
 
 
141 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  45.65 
 
 
139 aa  113  1e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 
139 aa  109  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  44.6 
 
 
142 aa  109  1e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 
139 aa  108  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  41.84 
 
 
141 aa  108  2e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  43.07 
 
 
145 aa  107  7e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  48.18 
 
 
146 aa  106  8e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  42.34 
 
 
144 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  44.29 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  44.2 
 
 
141 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  37.68 
 
 
140 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  42.03 
 
 
141 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  41.61 
 
 
151 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  40.15 
 
 
145 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  41.73 
 
 
139 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  42.45 
 
 
151 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  40.15 
 
 
139 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  43.07 
 
 
139 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  41.3 
 
 
139 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  38.03 
 
 
140 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  45.65 
 
 
139 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  43.38 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  38.24 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  37.96 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  38.69 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  39.57 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  39.57 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  38.24 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  42.45 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  36.96 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  37.23 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.78 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  35.51 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  39.57 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  36.03 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  42.34 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  37.68 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  39.42 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  42.14 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  41.61 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  39.29 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 
143 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  33.81 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  33.81 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  33.58 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  34.78 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  40.95 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  35.29 
 
 
140 aa  79.3  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  33.09 
 
 
141 aa  79.7  1e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 
141 aa  79.7  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.85206e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 
147 aa  79.3  2e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  31.11 
 
 
140 aa  78.2  3e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  37.76 
 
 
140 aa  77.4  6e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  34.31 
 
 
144 aa  75.9  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30.37 
 
 
141 aa  70.9  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  36.62 
 
 
140 aa  70.5  7e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  33.33 
 
 
150 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  34.06 
 
 
142 aa  69.3  2e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  32.17 
 
 
141 aa  68.6  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  31.65 
 
 
137 aa  68.6  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  30.22 
 
 
135 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  33.09 
 
 
150 aa  67  7e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  30.43 
 
 
136 aa  67  7e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  31.51 
 
 
141 aa  67  8e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  32.62 
 
 
137 aa  67  8e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  31.72 
 
 
139 aa  67  9e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  31.72 
 
 
139 aa  67  9e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  31.72 
 
 
139 aa  67  9e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  31.91 
 
 
140 aa  64.7  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  31.21 
 
 
136 aa  64.3  6e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  33.1 
 
 
145 aa  64.3  6e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  32.62 
 
 
136 aa  63.9  7e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  34.29 
 
 
141 aa  63.2  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  43.84 
 
 
109 aa  62  2e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  32.14 
 
 
144 aa  62.8  2e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 
136 aa  62.4  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
135 aa  62  3e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  31.21 
 
 
136 aa  60.8  6e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  32.2 
 
 
209 aa  60.8  6e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  31.21 
 
 
136 aa  60.8  6e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  32.19 
 
 
139 aa  60.8  6e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  31.21 
 
 
136 aa  60.8  6e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  30.07 
 
 
146 aa  60.5  7e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  28.99 
 
 
135 aa  60.8  7e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>