More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0042 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
332 aa  674  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 
342 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  43.11 
 
 
340 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 
347 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.32 
 
 
352 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
351 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.09 
 
 
351 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  38.91 
 
 
332 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
346 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
346 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
341 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
319 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
325 aa  196  4e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
348 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
348 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
347 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
349 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
332 aa  164  1e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.43 
 
 
347 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  37.63 
 
 
328 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  34.01 
 
 
331 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.99 
 
 
341 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.99 
 
 
341 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
346 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  31.88 
 
 
328 aa  152  6e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
335 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  32.66 
 
 
354 aa  133  4e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
352 aa  130  4e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  34.33 
 
 
322 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  30.47 
 
 
346 aa  122  1e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  29.18 
 
 
346 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
363 aa  117  4e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  30.57 
 
 
334 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  30.64 
 
 
363 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  30.64 
 
 
363 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  30.06 
 
 
349 aa  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
355 aa  111  1e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  30.72 
 
 
357 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
357 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  31.99 
 
 
358 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  28.81 
 
 
346 aa  108  9e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  31.06 
 
 
337 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  25.84 
 
 
335 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
338 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  29.63 
 
 
343 aa  99  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  32.55 
 
 
349 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
358 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  30.75 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.74 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  29.1 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  25.96 
 
 
339 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  30.38 
 
 
329 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.68 
 
 
327 aa  85.1  1e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.11 
 
 
334 aa  85.1  2e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.38477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  26.74 
 
 
357 aa  84.3  3e-15  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  26.79 
 
 
341 aa  84  3e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  26.79 
 
 
341 aa  83.2  6e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  26.75 
 
 
341 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
339 aa  81.6  2e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  28.83 
 
 
329 aa  81.3  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
358 aa  81.3  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  28.83 
 
 
329 aa  81.3  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
352 aa  79.3  7e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  2.97127e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  26.46 
 
 
334 aa  79  1e-13  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  27.22 
 
 
332 aa  78.2  2e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
333 aa  77.8  3e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
328 aa  76.6  5e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.81 
 
 
340 aa  76.6  5e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25.69 
 
 
329 aa  76.6  6e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
329 aa  76.3  7e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  43.8 
 
 
155 aa  75.9  8e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  26.62 
 
 
336 aa  75.5  1e-12  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  26.96 
 
 
336 aa  75.5  1e-12  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 
347 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.14 
 
 
329 aa  74.7  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.14 
 
 
329 aa  74.3  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  28.4 
 
 
328 aa  74.3  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  27.52 
 
 
342 aa  73.6  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10818  hypothetical protein  38.38 
 
 
151 aa  73.6  4e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  9.07114e-05  normal  0.897069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
348 aa  73.2  6e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
319 aa  73.2  6e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
355 aa  72.8  7e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  27.33 
 
 
335 aa  72.4  9e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  26.33 
 
 
335 aa  72  1e-11  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.91 
 
 
333 aa  72  1e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
318 aa  71.2  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  23.79 
 
 
334 aa  71.6  2e-11  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
334 aa  71.6  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 
320 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.65 
 
 
338 aa  70.9  3e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.65 
 
 
338 aa  70.9  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
347 aa  71.2  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.45 
 
 
335 aa  71.2  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.65 
 
 
335 aa  70.9  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
329 aa  70.9  3e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  27.89 
 
 
335 aa  70.9  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>