More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4203 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1190  integrase  96.62 
 
 		 386 aa  751    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  100 
 
 		 386 aa  802    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  89.12 
 
 		 386 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  77.46 
 
 		 386 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  76.68 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  75.39 
 
 		 386 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  75.39 
 
 		 386 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  77.49 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  67.88 
 
 		 386 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  55.18 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  54.81 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  54.55 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  54.03 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  56.69 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  53.1 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  52.56 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  46.56 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  46.3 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  49.23 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  50.93 
 
 		 326 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  45.35 
 
 		 374 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  45.35 
 
 		 374 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  51.75 
 
 		 409 aa  308  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  48 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  47.69 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  48.08 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  48.77 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  48.77 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  48.77 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  48.77 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  48.77 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  44.73 
 
 		 402 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  61.23 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  40.45 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  43.5 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 465 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 465 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  41.98 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  41.98 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  42.44 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  42.64 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  46.57 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  43.22 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  40.41 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  43.99 
 
 		 320 aa  272  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  40.59 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  43.99 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  45.71 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  46.18 
 
 		 342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>