More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4452 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  100 
 
 		 243 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  85.6 
 
 		 243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  71.07 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  71.07 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  69.83 
 
 		 242 aa  361  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  68.88 
 
 		 245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  68.88 
 
 		 251 aa  358  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  70.37 
 
 		 247 aa  354  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  65.84 
 
 		 259 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  66.8 
 
 		 248 aa  351  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  66.26 
 
 		 248 aa  348  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  67.08 
 
 		 247 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  65.56 
 
 		 245 aa  345  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  66.53 
 
 		 242 aa  344  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  65.98 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  65.98 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  65.98 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  63.64 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  64.32 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  65.83 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  64.73 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  62.14 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  64.32 
 
 		 243 aa  330  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  63.64 
 
 		 242 aa  329  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  61.16 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  61.16 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  64.02 
 
 		 247 aa  323  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  62.45 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  60.17 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  54.32 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  58.68 
 
 		 174 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  58.58 
 
 		 190 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  56.63 
 
 		 190 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  58.08 
 
 		 176 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  56.21 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  54.17 
 
 		 189 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 175 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  54.07 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.49 
 
 		 175 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  49.41 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  51.5 
 
 		 179 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  48.24 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  47.67 
 
 		 188 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  48.82 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  48.82 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  48.8 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  48.35 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  51.3 
 
 		 159 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  43.86 
 
 		 179 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  45.83 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.86 
 
 		 159 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.2 
 
 		 167 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  46.2 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  43.95 
 
 		 159 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  45.86 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  45.62 
 
 		 163 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 		 160 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  43.4 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 		 160 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  53.03 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  43.75 
 
 		 161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  43.75 
 
 		 161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  54.33 
 
 		 166 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  53.12 
 
 		 168 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  45.57 
 
 		 161 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.31 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 161 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 		 158 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.04 
 
 		 158 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  45.28 
 
 		 160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  43.51 
 
 		 157 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.34 
 
 		 168 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.82 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 169 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  42.42 
 
 		 166 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  51.56 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  49.64 
 
 		 169 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  50.77 
 
 		 192 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 185 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  47.1 
 
 		 166 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.04 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  45.26 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.58 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  50 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  40.13 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  53.54 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.56 
 
 		 183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  53.54 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  46.67 
 
 		 157 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 		 157 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 		 157 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 		 157 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  41.82 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.25 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.31 
 
 		 157 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  50.78 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  49.23 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>