54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4002 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  907    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  81.67 
 
 		 453 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  55.9 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  58.92 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  56.18 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  54.74 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  55.24 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  42.43 
 
 		 457 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  40.38 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  39.18 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  42.39 
 
 		 458 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  41.4 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  43.67 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  35.68 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  31.84 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  24.27 
 
 		 939 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.84 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  31.58 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0782  ADP, ATP carrier protein  22.04 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00645947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  25.71 
 
 		 803 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  22.9 
 
 		 666 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  23.23 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.84 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 512 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.03 
 
 		 511 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 528 aa  46.6  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  22.4 
 
 		 547 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.84 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.81 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.46 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.46 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  23.46 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.84 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.84 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  23.31 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.33 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  24.81 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 529 aa  43.9  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>